萬佛寺座落於沙田排頭村山上,創建於1949年。當年由南洋兄弟煙草公司的簡玉階居士將沙田火車站旁山上的私產「晦思園」贈予月溪法師。法師原擬在此創辦佛學院,後因故擱置,最後用作興建萬佛寺。至1957年(丁酉年)落成,歷時九載,面積佔地八公頃,自此成為香港著名禪林,法緣極盛。
萬佛寺在1982年開始進行局部性的翻新及重建工程。工程包括重建韋馱亭、觀音亭和十八羅漢廊,翻新萬佛寺和萬佛塔。又為佛像、菩薩和羅漢鋪上金箔及添上新色彩。
左邊為翻新前,右邊為翻新後。
1997年7月,因連場暴雨關係,萬佛寺背後的數幅斜坡被沖毀,整個寺院(包括高低層)受到不同程度的損毀,最嚴重的是位於高層的玉皇殿及觀音殿。經過差不多兩年時間的重修,低層寺院才能重開供遊人及善信們進香參觀。但高層部份仍然封閉進行維修,等到全部維修工程完成後才能重開。
現今萬佛寺現任主持吳星達居士為使萬佛寺更加壯觀輝煌,遂於2000年開始展開了一項浩大的工程──在室外塑造和安放如真人大小的五百金羅漢像群。一俟工程完成,相信萬佛寺將會成為世界上獨具特色的一個佛教景點。